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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

美国证实：尼泊尔坠机事故遇难者中含两名美国公民******

　　中新网1月19日电 综合外媒报道，美国国务院当地时间18日证实，15日在尼泊尔坠毁的雪人航空公司客机遇难者中包括两名美国公民和两名合法永久居民。

　　据报道，国务院发言人普莱斯证实，机上共有四名美国公民和永久居民，但没有透露他们的身份。

　　普莱斯在例行记者会上表示：“我们与机上人员的家人同在。在这个困难的时刻，美国随时准备以任何方式支持尼泊尔。”

　　此前报道称这架飞机的乘客来自印度、俄罗斯、韩国、爱尔兰、澳大利亚、阿根廷和法国，当时没有报告显示有美国人在尼泊尔30年来最致命的这起飞机事故中丧生。

　　尼泊尔雪人航空公司一架客机15日在尼中部博克拉地区塞蒂河峡谷附近坠毁。失事航班共搭载68名乘客和4名机组人员，目前已有71名遇难者遗体被找到。失事客机的黑匣子已被发现，尼泊尔政府将把该数据记录器送往法国，作为调查的一部分。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）